【导语】近日，同济大学附属第十人民医院秦环龙教授、秦楠教授和上海市公共卫生临床中心卢洪州教授与团队在Springer Nature主办的Research Square平台以预印论文的形式公布了正在Microbiome杂志审稿的研究“The Volatile and Heterogenous Gut Microbiota Shifts of COVID-19 Patients Over The Course of A Probiotics-Assisted Therapy”，报道了新冠肺炎患者在益生菌辅助治疗过程中肠道微生物的变化。
编辑 | Shawne 关键词 | 新冠肺炎 益生菌 研究
图源/In Review
目前新冠肺炎还没有明确有效的治疗方法，而全世界的疫苗接种可能也需要数年时间才能完成。鉴于患者可能表现出严重的胃肠道症状和微生物异常，将益生菌纳入可能会改善其治疗效果。
近日，同济大学附属第十人民医院秦环龙教授、秦楠教授和上海市公共卫生临床中心卢洪州教授团队采用益生菌辅助疗法对一组新冠肺炎重症患者进行治疗，并通过16S rRNA基因测序和宏转录组测序技术监测治疗过程中肠道微生物群和临床表现的动态。
该项研究成果“The Volatile and Heterogenous Gut Microbiota Shifts of COVID-19 Patients Over The Course of A Probiotics-Assisted Therapy”正在Microbiome杂志审稿中，同时在Springer Nature主办的Research Square平台以预印论文的形式公布。
研究结果表明，新冠肺炎患者表现出显著的肠道微生物紊乱，其特点是微生物多样性减少，微生物种类、功能和转录活性都发生了巨大改变。采取大剂量的益生菌辅助治疗，疾病症状有了明显改善，炎症指标降低。同时，肠道微生物组成也有了明显恢复。
一、新冠肺炎患者肠道菌群极度紊乱
物种组成的改变主要表现在新冠肺炎患者肠道中肠球菌（Enterococcus）、红球菌（Rhodococcus）的相对丰度显著增加，而抗炎相关的粪杆菌(Faecalibacterium)、罗斯氏菌(Roseburia)和梭菌XIVa（Clostridium XlVa）的相对丰度显著减少。
通过宏转录组数据的分析也发现了患者肠道中机会致病菌的转录活性相对提高，包括大肠杆菌（Escherichia coli）, 沙门氏菌（Salmonella enterica）, 耳葡萄球菌（Staphylococcus auricularis） 和肺炎克雷伯菌（Klebsiella pneumoniae），而肠道主要共生菌普氏粪杆菌（Faecalibacterium prausnitzii）的转录活性则明显降低。重要的是患者个体间异质性和时间点间波动巨大，表现为最丰富或转录活性最高的微生物分类往往在患者之间和治疗各时间点间差别很大。肠道微生物物种和功能上的改变与疾病严重程度相关。
图：新冠肺炎患者肠道菌群极度紊乱，且患者间差异巨大
来源/文章作者
二、益生菌辅助治疗明显改善新冠症状和肠道微生物
研究采取大剂量的益生菌（2000亿CFU/天，主要成分包括B. lactis subsp. HNO19, L. casei subsp. Lc-11, L. plantarum subsp. Lp-15, B. lactis subsp. B420, B. longum subsp. BL05, L. format subsp. Lg-36, L. rhamnosus subsp. Lr-32, L. paracasei subsp. Lpc-37, and L. salivarius）辅助治疗，通过14天的治疗后，疾病症状有了明显改善，炎症指标降低，包括血清肿瘤坏死因子-α（tumor necrosis factor-α,TNF-α)、白介素-1β(interleukin-1β, IL-1β)，白介素-4(interleukin-4, IL-4)和白介素-12P70 (interleukin-12P70, IL-12P70)。
同时，肠道微生物组成也有了明显恢复，其表现为肠球菌（Enterococcus）、红球菌（Rhodococcus）的相对丰度减少以及粪杆菌(Faecalibacterium)和罗斯氏菌(Roseburia)丰度的增加。大肠杆菌（Escherichia coli）, 沙门氏菌（Salmonella enterica）, 耳葡萄球菌（Staphylococcus auricularis） 和肺炎克雷伯菌（Klebsiella pneumoniae）机会致病菌的转录活性相对降低，而普氏粪杆菌（Faecalibacterium prausnitzii）和人罗斯拜瑞氏菌（Roseburia hominis）等抗炎相关菌的转录活性则明显提高。
研究还发现部分高龄或免疫状态低下的患者的菌群恢复情况相对较差，这表明了治疗的效果可能与患者的年龄和免疫状态有关。
该项研究首次报道了使用益生菌辅助疗法对新冠肺炎患者进行治疗，研究表明新冠肺炎患者缺乏肠道微生态稳定性，需要采取措施改善患者的肠道微生态扰动，以改善预后。而加入益生菌对治疗新冠肺炎患者是相对安全的，并可能有助于改善其预后，这些研究成果对于新冠肺炎患者的治疗以及预后都有着很重要的临床意义。
文献来源：DOI：10.21203 / rs.3.rs-72753 / v1
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