9月28日,四川大学华西医院、华为技术有限公司、赛乐基因科技(北京)有限公司联合发布多组学数据加速分析平台,该平台将30X人类WGS胚系变异分析时间缩短至7分钟,是多组学数据分析领域的重大阶段性进展。
文章 | 赛乐基因
编辑 | Kathy审核 | Kathy
关键词 | 多组学数据加速分析平台
9月28日,在“四川大学125周年校庆活动暨第七届生物医学大数据·智能技术应用峰会”开幕式上,四川大学华西医院、华为技术有限公司、赛乐基因科技(北京)有限公司联合发布多组学数据加速分析平台,该平台基于GPU加速,集数据存储、计算、管理、使用为一体,旨在推动基因测序技术创新,加速医疗行业数字化转型。

图:多组学数据加速分析平台发布会(来源/赛乐基因)
目前,基于该平台已经取得重大阶段性进展:30X人类WGS胚系变异分析时间从24小时缩短至7分钟,这是全球首次将人类全基因组分析推进至分钟级时代,在多组学数据分析领域具有跨时代的意义。
随着新一代基因测序技术和测序仪的发展,基因测序速度不断提升,测序成本不断下降,人类全基因组的测序成本从过去的30亿美金已经下降到500美金,由此带来了基因相关科学研究和应用的快速发展。
目前基因测序技术已经在生育健康、肿瘤个体化诊断和治疗、遗传病、传染病检测、疫苗研发等领域获得广泛的应用,为精准医疗和个性化医疗带来众多革命性创新。
与基因行业的快速爆发相对应,基因测序数据则呈现指数级增长趋势,未来有可能比肩天文数据量。当前每台最先进的基因测序仪每天产生的测序数据已经达到6TB,每年产生的数据则高达数十PB,且需要永久保存。
为了及时分析这些海量的基因数据,测序企业和科研机构往往需要投入高额资金建设高性能计算集群和数据中心。因此,基因数据的分析速度与成本日益成为掣肘基因测序行业发展的关键因素。如何提升基因数据的分析效率、降低成本投入成为业内公认必须解决的新课题。
此次三方创新合作,充分发挥了华西医院在多模态组学数据分析和基因应用等领域的领先学术和产业优势,华为公司在高性能数据存储和先进基因数据管理系统上的技术积累,以及赛乐基因在GPU加速生物信息数据分析领域的行业经验。
面向未来,三方的创新合作有望在基因测序领域,以数据为驱动,以创新为引擎,加速数据与存储技术赋能生物科技产业,促进甚至引领医疗行业的数字化变革。

图:华西医院数据科学家于浩澎博士于发布会上演讲(来源/赛乐基因)
于浩澎博士在发布会上表示:“多组学大数据时代已经到来,华西医院多组学数据加速分析平台创新性地引入华为OceanStor Pacific面向多样化算力的融合分析数据底座,以及赛乐基因BaseNumber基因数据分析GPU加速方案,推动多组学数据分析迈入分钟级时代。此项研究成果的发布,将加速精准医疗大数据在医学上的广泛应用。”
华西医院作为医学科研机构的龙头,深刻理解医疗行业业务需求,赛乐基因在基因数据分析技术领域深耕多年,华为公司则能提供最好的数据基础设施平台。此次ICT技术与生命科学的融合创新,将加速智慧医疗产业发展,为未来的基因科学做出贡献,促进人类的健康福祉。
扩展阅读
【声明】为了服务基因及数字生命健康科技推广、产业创新及产学研用连接,基因慧秉持专业、赋能、中立的立场收集、分析、发布信息或专家见解。但由于时效性及行业特殊性,所刊登内容仅供研究参考,不作为决策依据;本文相关信息不代表基因慧的观点;基因慧平台刊登的原创内容的知识产权为“基因慧”商标拥有者及相关权利人所有;欢迎转载,转载请申请并注明来源。欢迎个人及机构投稿及合作。
关于我们
基因慧是一家数字生命健康产业创新服务平台,创立于 2016 年。创始团队深耕行业十余年,创建了产业信息数字化平台YourMap®,为政府、研究机构及企业提供产业咨询及科技推广服务,践行“使连接产生价值,用数据看见未来”的理念,与90%知名基因机构建立了合作,逐步拓展生命科技及产业创新服务。
☆中国遗传学会生物产业促进委员会委员
☆ 连续四年发布基因行业蓝皮书
☆ 主办数字健康私董会、大湾区生命健康创新论坛
☆ 广东省精准医学应用学会政策研究应用分会常委
使连接产生价值
用数据看见未来
