十万奖金 | 2019年第二届全国NGS建库技能大赛

十万奖金 | 2019年第二届全国NGS建库技能大赛

关键词/NGS建库 Qsep
建库好,测序才好;测序好,基因数据才能更好服务临床。为响应国家“创新驱动,科技强国”战略,建设创新型国家,引领时代科技革命和产业革命,中国遗传学会遗传诊断分会和上海市遗传学会将在上海举办第二届全国NGS建库技能大赛(简称NLPSC)。本次大赛于2019年5月28日启动,经组委会为期数月的报名遴选,将于2019年10月24日正式开始。
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图:2019年第二届全国NGS建库技能大赛官网(来源/主办方)
近年来,高通量测序技术(next generation sequencing,NGS)迅猛发展,除DNA靶向捕获测序,RNA测序,外显子测序,全基因组测序等广泛应用科研外,NGS在临床方面也拓展至产前诊断,肿瘤早筛及用药指导等方面。
由于缺乏相应规范和人才稀缺,数据质量成为基因技术应用和推广的桎梏。
我们知道,测序数据的好坏取决于建库质量。针对于NGS的建库,除了普及基础建库技术,包括肿瘤体细胞突变和胚系突变高通量测序检测的建库技能,还需要提供解决共性问题的能力。
在单分子测序技术尚未完全成熟之前,NGS在大片段建库方法仍有巨大的市场,但是需要更为简化的流程。例如,2019年6月7日,香港中文大学妇产科学系董梓瑞博士团队在DNA RESEARCH上在线发表文章,提供了一种成本合理且高效率的大片段文库构建方法,该方法可用于人类疾病中各种基因组变异的检测,具有广阔可期的临床应用前景。
  活动简介 
2019第二届全国NGS建库技能大赛
2019年10月18日—12月20日
【主办单位】 中国遗传学会遗传诊断分会、上海市遗传学会
【承办单位】上海市临床检验中心、遗传工程国家重点实验室
【协办单位】全国卫生产业企业管理协会精准医疗分会
【支持媒体】基因慧
 大赛设置 
理论知识(成绩占20%)和实操技能竞赛(成绩占80%)两部分。
【实操技能竞赛】
时间:2019年10月24日—11月9日
地点:复旦大学江湾校区生命科学学院G206室(上海市杨浦区淞沪路2005号)
【理论知识竞赛】
时间:2019年11月—12月
地点:上海市临床检验中心(上海市浦东新区洪山路528号)
【大赛奖项】
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图:大赛奖项设置(来源/主办方)
 大赛指定建库质控仪器 
作为大赛指定建库样本质控仪器的提供方,厚泽生物参与了第一届全国NGS建库技能大赛,提供Qsep100全自动核酸蛋白分析系统并获得了参赛医院、第三方检验公司和科研院校等的一致好评。
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图:NGS核酸质控设备——Qsep系统(来源/厚泽生物) 
Qsep100全自动核酸蛋白分析系统为什么会受到大赛认可呢?
1)高分辨率
极大程度的从结果中反映样本真实情况。
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图左:高分辨率分析图;图右:超高分辨率卡夹C1结果图(来源/厚泽生物)
Qsep系列产品分辨率可达到1%,图左显示在200bp处,Qsep可清楚分辨2bp差异的条带。该分辨率高于市场上的同类产品,为检测的准确性和可靠性提供最大程度的保障。图右显示Qsep系列产品在100bp左右,可分辨1bp差异的条带。
2)高灵敏度
保证低浓度样本的检测准确性。
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图左:PCR产物;图右:cf/ct DNA质控(来源/厚泽生物)
Qsep系列产品可检测最低浓度为1 pg/μL ,图左显示S2标准卡夹测试单峰产物灵敏度即可达5 pg/μL。图右为高敏卡夹检测cf DNA 样本结果,显示样本浓度7 pg/μL,平均大小为174bp。
3)通量灵活
非常适合NGS平台的质控工作。
第一届全国NGS建库技能大赛中Qsep100产品部分实验结果展示。
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图左:捕获前文库质控结果;图右:4个扩增子文库质控comparison(来源/厚泽生物)
Qsep系列的应用方向和特色
质控:NGS和三代测序质控
多重PCR产物分析:Y染色体微缺失、地贫基因分型和多重病原菌检疫等
替代部分一代测序的功能:进行需要极高分辨率的SSR微卫星分析等
蛋白分析
替代传统的琼脂糖凝胶电泳仪
高分辨率基因分型
合成引物分析
质粒DNA酶切、构造及纯度分析
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图左:Qsep1-C-1;图右: Qsep100-3(来源/厚泽生物)
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图左:Qsep400;图右: Qsep100 advance(来源/厚泽生物)
关于厚泽生物
厚泽生物科技有限公司是一家集科学仪器、耗材、试剂的销售、推广和售后服务为一体的高科技生物企业。公司成立于2013年6月,总部位于杭州,在北京、上海、广州、成都等大型城市设立办事处。以“用户至上,用心服务”为核心价值,以技术为基础,以品质求发展,服务国内外科研院校、检测机构等合作伙伴。
 
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