从互联网发展看NGS趋势,创新开发者在3月杭州等你

从互联网发展看NGS趋势,创新开发者在3月杭州等你

关键词:互联网发展
NGS创新创业
创业者的聚会创新思想的汇合
3540字,建议用时9分钟
作者:NGS创新开发者协会成员基因慧
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图来自genengnews.com
1980年
个人电脑推动互联网大众化
1980年12月12日,苹果公司(Apple)上市(NASDAQ:AAPL),当时市值约17亿美元,当前市值6399亿美元。
上市前的第四年(1976年),苹果电脑公司(Apple Computer Inc. )由史蒂夫·乔布斯、斯蒂夫·沃兹尼亚克和罗·韦恩等人创立,生产了世界上第一台个人电脑(Apple II),开创性地将硬件和软件绑定。27年后,在推出智能手机iphone的同年2007年1月,更名为苹果公司,次年推出AppStore,使得人们线上下载为iPhone SDK或Mac开发的应用程序,将软件开发的接口开放。
2015年,WWDC 上苹果发布支持可以收集 DNA 的ResearchKit 应用组件。
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图:Apple II
  
1986年
用户友好的软件普及应用
1986年3月13日,微软公司(Microsoft)上市(NASDAQ:MSFT),当时市值5亿美元,当前市值5012亿美元。
上市前的第11年,由比尔·盖茨与保罗·艾伦创办。以研发、制造、授权和提供电脑软件服务业务为主,最知名的产品为Microsoft Windows操作系统和Microsoft Office系列软件,在全球电脑软件服务领域独占鳌头。2008年微软推出云计算系统Windows Azure,2012年取得入华牌照,据悉在中国北部和东部两个主要城市运行数据中心。
2016年6月,微软Azure云和药明康德集团下属公司明码生物科技合作,将微软用户能够对基因数据进行管理、信息挖掘和可控共享。
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图:windows 98
 
 
1996年
门户网站百花齐放
1996年4月12日,雅虎公司(YAHOO! )上市(NASDAQ:YHOO),当时市值约5亿美元,当前市值约397亿美元。
这家全球第一家提供因特网导航服务的网站,上市的2年前由杨致远和大卫-费罗创立。2015年雅虎作为全球最大的门户网站,已成为“全球第三大移动广告公司”。 2016年7月,48亿被美国电信巨头Verizon(威瑞森)收购后,改名Altaba,被中国网友戏称为“阿里他爸”(雅虎目前持有阿里巴巴15%的股份,价值约为350亿美元)。而1998年、2000年的上市的新浪、搜狐作为国内最大的门户网站之一先后微博、视频等在移动互联进程中保持自身的品牌优势。
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图:Yahoo logo
1997年
云计算服务提供易用的计算资源
1997年5月15日,亚马逊公司上市(NASDAQ:AMZN),当时市值175亿美元,当前市值约3841亿美元。
作为全球商品品种最多的网上零售商和全球第二大互联网企业,仅在上市前的两年前成立。一开始只经营网络的书籍销售业务,现在则扩及了范围相当广的其他产品,2006年亚马逊开始推出Amazon Web Services (AWS) 以Web服务的形式提供IT基础资源,即云计算。
AWS为多个领域提供云计算服务,在生命科学领域,基因组大数据和云计算的融合催生了DNAnexus, SevenBridges, Galaxy等为基因产业提供云服务的中间商;同时与Illumina, Celegene, Penn State, Claritas Genomics等基因组数据生产的企业展开合作。
 
2004年
搜索引擎,缩短信息获取路径
2004年8月9日,谷歌公司(Google)上市(NASDAQ:GOOG),当时估值约230亿美元,当前估值约5541亿美元。
作为全球最大的搜索引擎,谷歌公司在上市的6年前,由拉里·佩奇和谢尔盖·布林共同创建。目前的主要业务包括互联网搜索、云计算、广告技术,主要利润来自于AdWords等广告服务。
2014年,Google和遗传数据机构合作推广成立Google Genomics项目,参与者包括专门从事生物医学研究的Broad Institute遗传研究中心、哈佛、MIT的科研团队。 
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图:Google Genomics 
 
2012年
互联网社交连接人和人
 
2012年5月18日,Facebook公司上市(NASDAQ:FB),当时市值约1152亿美元,当前市值3661亿美元。作为全球最大的社交服务网站,在2004年由扎克伯格创立,目前月活跃用户数量高达16.5亿(根据2016年第一季度财报),单日用户数突破10亿。
2014年10月3日,欧盟反垄断监管机构正式批准了Facebook以190亿美元收购移动消息初创公司WhatsApp的交易。它将成为Facebook公司历史上规模最大的收购交易。Facebook将凭借WhatsApp在快速成长的移动互联市场站住脚跟。
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图:亚马逊云计算服务 AWS
从如上的几个时间点和事件,笔者尝试串起来,来探索互联网发展轨迹可能存在的“线”,
·      硬件:小型化和成本可控让互联网普及率提高;
·      软件:用户友好界面提升使用效率;
·      信息池:门户网站集中信息池,连接人和信息;
·      云计算:共享机制降低资源使用成本;
·      搜索:缩短信息查询路径;
·      社交:连接人和人;
……
 
有读者可能会argue互联网的受众是大众,与基因行业目前覆盖率不可同日而语。细心的读者应该会想到,互联网的载体是计算机,计算机一开始应用于国防,很巧的是,开创基因组大规模研究的”人类基因组计划“是1985年美国能源部提出的。计算机走向千家万户,基因终将成为日用品,因为它的本质是健康管理。
同时,回顾互联网企业的发展,最终大部分活下来的企业都将触角伸到基因组领域,因为基因组产业的大数据、临床应用和健康管理两个维度,是绝佳的信息载体和跨界连接点。
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第一台测序仪abi prism 310型基因分析仪
 
再者,如果——尝试着——把这串“线”上的点映射到基因组领域,都可以找到其中已经发生、正在发展、即将进化的路线。
硬件小型化、高通量
从第一台低通量的ABIPrism 3730,到第一台新一代测序仪454GS2.0,再到高通量的1.8T/天的NovaSeq,一个人全基因组生产成本从亿美元级别下降到百美元,硬件成本可控。从台式测序仪到手持纳米孔测序仪(MinIon),硬件的小型化使得操作易用,使得大众操作普及成为可能。
软件平台化
从早期的基于Linux系统的软件包,到少数的图形化界面入口,再到众多云计算平台包含的建议操作平台,提升了用户友好体验;同时除了AWS,Google,微软等,国内BAT、华为等纷纷加入基因组云计算基础设施提供商阵列,推动计算资源的成本降低。
信息分享
已形成NCBI(美国), EBI(欧洲), DDBJ(日本)三大DNA数据库;同时,中国已建立起国家基因库,在此基础上,假以时日,国内的DNA数据库门户站点将形成庞大信息池。同时,面向大众的信息池尚未建立。
围绕基因的社交
目前主要以基因相关的同类疾病的患者社交为主,比如MyGene2网站,以及国内的“同并相联”网站等。以基因本身的社交,WeGene在探索线上社区。
搜索引擎
基于基因的搜索目前尚停留在基因和临床的关联上,表型(症状的标准化描述)、基因、疾病之间的相互关联。
外延和深度扩展的……
除了以上之外,我们可以看到很多问题需要外延和落地的解决方案,比如
·      围绕基因的大众化门户网站尚未出现
·      基于基因本身的泛娱乐社交
·      以基因或者相关的关键词的健康领域搜索引擎
·      多维度的信息池等等
 
基因本身是科学性的,同时,服务于医疗健康,计算机时代过去了,互联网趋于平稳,移动互联浪潮已过,关乎到每个人的医疗健康领域方兴未艾,而在这个领域,当移动医疗的应用场景依然不明朗,传统医疗体制问题尚需解决的情况下,以基因为核心的精准医疗成为一个可待探索的领地。基因产业目前以新一代测序技术为主,简称NGS。随着2016年精准医疗纳入国家十三五计划,近百万人群队列研究启动,接下来的3到5年,NGS的创新创开发将是一个核心主题,围绕基因数据的分析解读、落地临床诊疗、与医疗信息化的结合、外延到人工智能和移动医疗的结合,仍然需要创业者和行业参与者创新、合力共建。
 
围绕NGS创新创业“NGS创新开发者大会”关注技术创新和创业者。向行业介绍在技术和模式创新的开发者和创业者,连接创业人和资本方,少了空谈和头衔,是圈子内少有的一股清流。
 
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NGS创新创业者的聚会
第一届大会于2014年2月在北京召开,Illumina主办
·       斯坦福大学的王春林博士介绍了HLA的高通量测序方法,参与创办的公司已经成功出售
·       美国阿尔法研究院的韩健博士分享了免疫组库测序技术,创办的公司已经成为免疫组库研究领域的标杆企业
·       江苏亿康的王春香博士介绍单细胞扩增技术,亿康于两年后获得1.3亿元左右的投资
·       清华大学的田埂博士演讲了空气中微生物研究,后离开清华大学创办的元码基因,已获得大额融资
·       中国疾病预防控制中心的陈晨博士分享了微生物基因核心分型方法,其参与创办的华点云聚焦在临床基因技术转化云计算平台
·       第一届大会上,参与的资本方有君联资本蔡大庆、美年大健康俞熔等
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图:第一届NGS创新开发者大会现场
 
第二届大会于2015年4月11日在北京召开,离开Illumina后在2014年创业的郝向稳创立基云惠康,协调组织各方,由Illumina、测序中国、SeqE智库、创新医疗主办。讲者包括:
·       中科紫鑫测序仪研发核心成员任鲁风
·       Bionano公司的创始人曹涵博士
·       东南大学纳米孔测序专家凌东新教授
·       研究循环肿瘤细胞(CTC)来自北京大学的白凡博士和循环肿瘤DNA(ctDNA)来自源正细胞周向军博士
·       从事NIPT产品研发的百世嘉刘子人经理
·       肠道微生物的深圳谱元创始人覃俊杰博士
·       南方科技大学贺建奎教授
·       研究检测低频突变的来自中科院的王开乐博士
·       从事云计算解决方案探索的创业者华点云创始人陈晨博士、聚道科技联合创始人李夏戎、上海烈冰研发经理宗杰等
·       资本方,瑞银证券执行董事季序我做了精彩分享
第三届大会于2016年5月28日在北京召开,开始成立NGS创新开发者协会,由协会主办,协办方包括基云惠康、移动健康研究院、动脉网、测序中国、转化医学网。邀请了中科院、复旦大学等科研机构、碳云智能为代表的创新企业、以及君联资本、树兰医疗基金为代表的资本等:(基因慧曾对会议做过相关笔记,关注“基因慧PPT”可见)
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图:第三届NGS创新开发者大会现场 
第四届创新开发者大会就要来了,即将在2017年3月31日在极具创新创业氛围的杭州召开,主办方为NGS创新开发者协会,协办方为基云惠康、贝壳社、华点云、基因慧。会议主题包括:
·      纳米孔单分子测序
·      人工智能
·      无创产前单基因病检测
·      无创产前孕期肿瘤检测
·      三亲婴儿技术
·      生殖细胞外泌物检测技术
·      甲基化定位肿瘤细胞来源技术
·      细胞免疫治疗
·      ……
 
未来以来,只是尚未流行。
以科学和技术为基础的基因组产业,需要技术创新为驱动力,促进模式创业和应用落地。技术转化和应用场景结合、产业的扩大化和资本对接,才能建立有序的发展轨迹和行业规则。
在行业急速发展的时间窗口,创业者是走在前面的探路者,上下游之间的合力以及不同方向的互补,将会产生增值的化学反应,互利互惠。
创业者的聚会,创新思想的汇合;
我们在这里等您:
 
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图:第四届NGS创新开发者大会
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