基因行业资讯周报【GeneMail 97期】
（语音+文字）
1.总理鼓励开发无需实验室环境的核酸检测技术
2. 陈薇院士《柳叶刀》刊文新冠疫苗I期试验结果乐观
3. 谢晓亮团队通过单细胞测序筛选出新冠高活性中和抗体
4. 张泽民团队Cell刊文单细胞刻画结直肠癌患者的肿瘤微环境
5.单细胞测序SMART-seq3问世
6. FDA批准前列腺癌靶向药和伴随诊断
7. 杨辉等开发出高精度单碱基编辑工具
8. 基因编辑控制蚊子后代性别比例，防控传染病
9. 合成生物学突破，发现”个体生长分裂方程”
10. 上周3起战略合作，6起融资事件（含1起并购）
更多详情见基因慧GeneMail（文字+音频）（投稿 info@genonet.cn）
文章 | 基因慧 编辑 | Dylan 审核 | 布三少
头条
■ 陈薇院士在《柳叶刀》发表新冠疫苗成果
一期临床108例均产生抗体
当地时间5月22日晚间，中国军事科学院军事医学研究院生物工程研究所陈薇院士在The Lancet刊发研究成果，报告了在中国健康成年人中使用的Ad5载体COVID-19疫苗在接种后28天内的1期临床数据，一期临床108位志愿者均产生抗体和显著细胞免疫应答。
陈薇院士表示，这是一个重要的里程碑。试验表明，单次接种复制缺陷型人腺病毒5型（Ad5）载体新冠疫苗，在14天内就能诱导产生病毒特异性抗体和T细胞应答，这使其成为具有潜力的可以进行下一步研究的候选疫苗。
同时，陈薇院士也表示应谨慎解读。特异性抗体或T细胞在建立有效保护方面的作用尚未确定。为加快对这一候选疫苗的临床评估过程，研究团队根据1期接种后7天和14天的数据，已经启动2期临床试验，选用低剂量和中剂量进行进一步评估（参考“澎湃新闻”）
参考文献>>
Feng-Cai Zhu et al., Safety, tolerability, and immunogenicity of a recombinant adenovirus type-5 vectored COVID-19 vaccine: a dose-escalation, open-label, non-randomised, first-in-human trial, THE LANCET(2020)
政策
■ 总理鼓励研发无需实验室环境的核酸检测
事关常态化疫情防控的科学精准
在近日的大会上，总理关切地与一位院士委员讨论起新冠病毒核酸检测技术的最新进展，鼓励科学家们要尽快研发出无需实验室环境、检测时间更短、手段更便捷、准确率更高、更安全的核酸检测迭代技术。
总理语重心长地说，不要小看小小的核酸检测迭代技术突破，它事关常态化疫情防控能否做到科学精准，有力推动复工复产复业复市。这看似一个科学“小切口”，实质可以带来经济社会“大成效”。（参考“中国政府网”）
原文链接>>
http://www.gov.cn/xinwen/2020-05/24/content_5514393.htm
■ FDA批准前列腺癌靶向药和伴随诊断
当地时间5月20日，FDA宣传批准阿斯利康和默克公司的olaparib（Lynparza）用于具有同源重组修复缺陷的转移性去势抵抗性前列腺癌患者。
同时，FDA还批准了两种可用于确定对该药最佳反应者的伴随诊断方法：
1）Myriad Genetics的BRACAnalysis CDx用来识别具有种系BRCA1 / 2突变的患者
2）Foundation Medicine的FoundationOne CDx用来识别具有HRR突变基因的患者。
科研
■ 治疗新冠药物靶标新线索
——与新冠相互作用的蛋白质
加州大学旧金山分校的Nevan Krogan团队在Nature期刊最近发文，介绍了69种可药物化的、参与免疫调节以外过程的人类蛋白质。
值得关注的是，这里将药物靶标范围从病毒复制机制扩展到体内与SARS-CoV-2相互作用的蛋白质，其中，至少有13种候选药物已经在临床试验中（如下表）：
之前的药物如remdesivir直接抑制病毒的RNA聚合酶，试验数据表明，它可以缩短感染时间，但不能显著提高存活率。目前科学家也研究在疾病发展后期抑制病毒感染并缓解危及生命症状的药物。
更多详情>>
https://www.nature.com/articles/d41587-020-00013-z
■ 谢晓亮团队通过单细胞测序技术
成功筛选出多个新冠高活性中和抗体
5月18日，Cell 期刊在线发表了北京大学北京未来基因诊断高精尖创新中心（ICG）谢晓亮课题组与合作团队的研究成果，即基于用高通量单细胞测序技术，从新冠肺炎康复期患者血浆中成功筛选出多个高活性中和抗体。近日完成的小鼠实验已证实了该中和抗体的治疗和预防功效。目前，临床实验正在积极推进中。
中和抗体由人体免疫系统产生，可以有效阻止病毒感染细胞。目前，动物实验已证明该团队的中和抗体有望成为治疗新冠肺炎强效药，同时也可提供短期预防。（参考“北京大学”公众号）
更多详情>>
参考文献>>
Yunlong Cao et al., Potent neutralizing antibodies against SARS-CoV-2 identified by high-throughput single-cell sequencing of convalescent patients’ B cells, Cell(2020)
■ 张泽民教授团队再发Cell
通过scRNA-seq刻画结直肠癌患者的肿瘤微环境
4月16日，百奥智汇创始人、北大张泽民教授团队与合作者在Cell上发表研究成果，利用单细胞转录组测序技术对结直肠癌患者的肿瘤微环境，特别是浸润髓系细胞类群首次进行了系统性的刻画，同时利用小鼠模型，对anti-CSF1R抑制剂和anti-CD40激动剂两种靶向髓系细胞的免疫治疗策略潜在的作用机理给出了解释。 (参考“百奥智汇+”）
参考文献>>
Lei Z. et al., Single-Cell Analyses Inform Mechanisms of Myeloid-Targeted Therapies in Colon Cancer. Cell. 2020.
■ 单细胞测序SMART-seq3问世
每个细胞检测数千个转录本
当前的单细胞短读长RNA测序方法对RNA计数的能力有限，而长读测序技术缺乏跨细胞大规模应用所需的深度。5月4日，瑞典斯德哥尔摩卡罗林斯卡研究所联合多家团队，联合发布单细胞测序方法SMART-seq3，结合了全长转录组覆盖率和5’独特的分子识别剂RNA计数策略，可以对每个细胞数千个RNA分子进行重新建模，实现在单个细胞、单个allele、单个isoform水平上的计数。
参考文献>>
Michael Hagemann-Jensen et al. Single-cell RNA counting at allele and isoform resolution using Smart-seq3, Nature Biotechnology (2020)
▼ 2020《单细胞行业报告》
战略合作仅余1名
■ 杨辉等开发出高精度单碱基编辑工具
显著降低DNA脱靶
5月18日，中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心杨辉研究组、中科院计算生物学研究所李亦学研究组、以及中国农业科学院深圳农业基因组研究所左二伟研究组等合作在Nature Methods杂志上在线发表研究成果。
该研究根据蛋白结构预测了脱氨酶ssDNA结合的重要氨基酸，在不影响催化活性的情况下，使相应的氨基酸突变，实现显著降低DNA脱靶的新型单碱基编辑器（CBE）。（参考”BioArt“）
参考文章>>
参考文献>>
Erwei Zuo et al. A rationally engineered cytosine base editor retains high on-target activity while reducing both DNA and RNA off-target effects, Nature Methods (2020)
■ 首个人类骨骼发育路线图和基因网络被绘制
近日，加州大学洛杉矶分校（UCLA）的再生医学和干细胞研究中心的跨学科研究团队绘制出了人类骨骼肌如何发育（包括肌肉干细胞形成）的首个路线图。该研究发表在同行评审杂志Cell Stem Cell上，确定了骨骼肌组织中从早期胚胎发育一直到成年存在的各种细胞类型。
该论文的作者April Pyle谈道：“由于衰老或疾病引起的肌肉丢失通常是肌肉干细胞功能失调的结果，而这张图确定了整个发育过程中肌肉祖细胞和干细胞中存在的精确基因网络，这对于开发出在培养皿中培养细胞以治疗肌肉疾病的方法至关重要。”
参考文献>>
Haibin Xi et al., A Human Skeletal Muscle Atlas Identifies the Trajectories of Stem and Progenitor Cells across Development and from Human Pluripotent Stem Cells. Cell Stem Cell(2020)
■ 合成生物学 x 人工智能
汪小我团队设计并合成大肠杆菌全新启动子
5月19日，清华大学汪小我课题组在 Nucleic Acids Research 发表合成生物学研究成果，该项研基于人工智能算法，在大肠杆菌中成功实现了全新基因启动子的设计，并产生大量全新的启动子，实验验证成功率超过 70%。
参考文献>>
Ye Wang et al., Synthetic promoter design in Escherichia coli based on a deep generative network, Nucleic Acids Research(2020)
■ 合成生物学突破，发现”个体生长分裂方程”
揭示细菌细胞大小的决定因素
5月18日，中国科学院深圳先进技术研究院、深圳合成生物学创新研究院刘陈立研究组在Nature Microbiology发表研究成果，以大肠杆菌为模式生物，揭秘了细菌大小的决定因素，发现了全新的“个体生长分裂方程”，修正了该领域原有的两大生长法则，并对合成生物学领域生命体理性设计提供了相关建构基础原理。
正如“伯努利方程”指导了飞机的设计；“阿基米德浮力定律”推动了潜艇的面世；“牛顿第二定律”是人类得以翱翔地球外太空的重要理论基石，合成生物学的终极目标就是理性的设计、改造现有生命形式或者创造全新的生命形式以满足人类不同的需求（参考“iSynBio爱星博”）。
参考文章>>
参考文献>>
Chenli Liu et al., General quantitative relations linking cell growth and the cell cycle in Escherichia coli. Nat Microbiol(2020)
■ 基因编辑控制蚊子后代性别比例
防控疾病传播
我们知道，只有雌性昆虫传播疟疾、登革热和寨卡病毒等疾病；因此长期以来，科学家一直在寻找能使昆虫后代的性别比例产生偏差的控制方法，用于控制传播疟疾等媒介。
近日，英国伦敦帝国理工学院联合美国约翰霍普金斯大学等团队在Nature Biotechnology上发表研究成果，研发出基于CRISPR的基因驱动器（SDGD），可以控制冈比亚按蚊（Anopheles gambiae中的男性偏向性畸变。通过模型预计，SDGD对雌性蚊子种群的影响较之前研究更快，从10-14代的2.5％起始等位基因频率中产生了仅男性种群，且“种群崩溃”没有抗药性选择。
参考文献>>
Alekos Simoni et al., A male-biased sex-distorter gene drive for the human malaria vector Anopheles gambiae,Nature Biotechnology(2020)
应用
■ 首创唾液DNA筛查HPV导致的咽喉癌
△ 图1：咽喉解剖示意图
（来源/昆士兰科技大学官网）
昆士兰科技大学团队开发的一种简单的唾液DNA检测方法，可以对没有症状和临床表型的人检测到早期咽喉癌。据称这是世界首创的无创咽喉癌检测，基于唾液中的HPV DNA检测。
在美国，HPV导致的咽喉癌已超过宫颈癌，但与宫颈癌不同，到目前为止还没有针对这种类型的咽喉癌的筛查方法。
参考文献>>
Kai Dun Tang et al., An Occult HPV-Driven Oropharyngeal Squamous Cell Carcinoma Discovered Through a Saliva Test. Frontiers in Oncology(2020)
■ SMA基因疗法Zolgensma获欧盟委员会有条件批准
5月19日，诺华旗下的AveXis公司宣布，欧盟委员会（EC）有条件批准了Zolgensma用于治疗特定的SMA患者：包括SMN1双等位基因突变和临床诊断为 1型的5q SMA患者；或SMN1双等位基因突变且SMN2拷贝数最高为3的5q SMA患者。
根据被批准的给药剂量指导，此次获批适用于体重不超过21公斤的SMA婴幼儿患者。
此前，Zolgensma对于症状前和有症状的SMA患者显示出显著、且具临床意义的疗效，包括延长无事件生存期和达到自然病史中迄今未见的运动里程碑，并（这样的效果）在给药后已持续5年。（参考“美儿SMA关爱中心”）
产业
■ 燃石医学赴美IPO，拟募资1亿美元
美国东部时间5月22日，国内肿瘤基因检测行业企业燃石医学向美国证券交易委员会（SEC）公开递交了招股说明书（F-1），申请在纳斯达克交易所以“BNR”为股票代码挂牌上市。
根据招股书，燃石医学2017-2019年总营收分别为1.112亿、2.089亿和3.817亿元人民币，2017-2019年归属于公司所有者的亏损分别为1.313亿、1.775亿和1.692亿元人民币；2020年3月末，账面资金7.22亿元人民币。此次IPO承销商包括Morgan Stanley、BofA Securities、Cowen、CMBI和Tiger Brokers。
■ Thermo Fisher拟投资1.8亿美元建病毒载体制造厂
当地时间5月13日，Thermo Fisher表示，将投资1.8亿美元在马萨诸塞州新建一个生产基地，将现有病毒载体制造通量扩大一倍，以支持对基因疗法和疫苗日益增长的需求。工厂占地29万平方英尺，预计将于2022年完工。
■ 8家中国RNA企业上榜CB Insights
CB Insights近日发布影响未来的8家中国RNA企业，分别是：瑞博生物、圣诺生物、中美瑞康、斯微生物、艾博科技、深信生物、吉玛基因、锐博生物。
RNA 疗法指以 RNA 为基础的药物或疫苗。上世纪 70 年代，反义核苷酸的概念首先被提出。90 年代，RNA 干扰技术和 mRNA 药物的设想相继迸发，2001 年，siRNA 技术被Science期刊评为当年十大技术进步之一。CureVac、Alnylam、BioNTech、Moderna 等公司相继成立，专注 RNA 疗法的开发和应用。
从技术上，CB Insights 将 RNA 疗法分为三大类别：
1）以核酸（DNA 或是 RNA）作为靶向的疗法，这其中主要包括单链的反义寡核苷酸药物（ASO）、双链的RNA干扰药物（RNAi）以及其它小分子药物。而双链 RNA 干扰药物又以 siRNA（小干扰 RNA）以及 miRNA（微小 RNA）为主。
2）利用自身三维结构，以蛋白质为靶向的 RNA 分子药物，RNA 适配体药物属于这一分类。
3）以编码蛋白质为目的 RNA 疗法，这其中主要包括 mRNA 药物（IVT mRNA）以及 mRNA 疫苗等。（参考“DeepTech深科技”）
参考文章>>
■ 本周战略合作事件
【艾德生物 x 安进】5月22日，艾德生物与全球知名生物技术公司安进（Amgen）达成伴随诊断战略合作。根据协议，艾德生物基于自主专利技术开发的“肺癌多基因联合检测产品”（艾惠健®升级版），将用于安进非小细胞肺癌重磅靶向药物AMG510（针对KRAS基因G12C突变的不可逆抑制剂）在中国的伴随诊断，并将积极推进其在国家药品监督管理局的注册审批。
【吉因加 x 嘉检医学】5月15日，北京吉因加科技有限公司（简称“吉因加”）与广州嘉检医学有限公司（简称“嘉检医学”），宣布双方将在遗传性疾病和肿瘤基因检测领域开展战略合作，共建基于Gene+Seq-200/2000的遗传病与肿瘤检测临床应用。见证人为双方的投资人松禾资本代表杨瑾女士。
【泛生子 x 达瑞生物】5月14日，泛生子与达瑞生物签署战略合作协议，达瑞生物将基于泛生子基因测序仪 GENETRON S5（国械注准：20193220820，以下简称“GENETRON S5”）平台，开展病原微生物检测产品的开发及试剂盒注册报证。至此，GENETRON S5 平台已广泛应用于肿瘤、遗传病及病原微生物检测等多个领域，充分体现了该平台的应用场景多样性和产品研发开放性。
■ 本周投融资事件
当地时间年5月22日，罗氏官网宣布已收购测序技术公司Stratos Genomics公司，此次收购使罗氏得以利用Stratos Genomics独特的扩展测序（SBX™）技术，来加速开发罗氏的纳米孔测序仪，用于快速灵活、经济高效的临床诊断检测。融资金额未披露。
当地时间年5月21日，蛋白质组学公司Nautilus Biotechnology宣布已完成7600万美元B轮融资。Vulcan Capital领投，先前的投资者AME Cloud Ventures，Andreessen Horowitz，Bolt和Madrona Venture Group，以及新投资者Perceptive Advisors，Bezos Expeditions和Defy Partners跟投。
当地时间年5月20日，基于合成生物学寻找药物靶标的药物发现公司Octant，表示，已完成3000万美元的A轮融资。硅谷风险投资公司Andreessen Horowitz领投，8VC，SV Angel，Allen＆Co和其他一些未公开的私人投资者跟投。
当地时间5月19日，专注PCR产品开发的分子诊断公司ChromaCode周二表示，获得1000万美元的C轮融资，加上2019年12月的融资额，C轮融资的总价值达到3800万美元。新投资方为Adjuvant Capital。
当地时间5月14日，单细胞技术公司Immunai完成2000万美元的种子轮融资，由Viola Ventures和TLV Partners领投。Immunai由前哈佛大学及MIT团队于2018年12月成立，已开发出多组学单细胞分析平台，绘制免疫系统图谱，用来检测、诊断和治疗疾病。
战疫
■ 特朗普的新冠疫苗计划注资阿斯利康$12亿
首批疫苗将于10月交付
美国时间5月21日，特朗普政府主导代号为“Operation Warp Speed”的COVID-19疫苗计划。宣布对阿斯利康开发的一种疫苗投资高达12亿美元，并要求首批至少3亿剂疫苗于10月交付。
美国卫生和公共服务部（HHS）表示，今年夏天该疫苗可能会在美国进行30000人的功能验证试验。阿斯利康（AstraZeneca）则在一份新闻稿中表示，计划9月在英国牛津的疫苗生产线提供提供疫苗。
■ Moderna公司表示新冠疫苗MRNA-1273安全且耐受性良好
当地时间5月18日，Moderna公司表示用于新冠肺炎的疫苗MRNA-1273是安全且耐受性良好的，预计在7月开始最终阶段的疫苗试验，当日盘前涨幅扩大至逾30%。
参考文章>>
https://investors.modernatx.com/news-releases/news-release-details/moderna-announces-positive-interim-phase-1-data-its-mrna-vaccine?from=timeline&isappinstalled=0
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