【导语】在NGS技术中，RNA-seq是目前被用得非常广的一种技术。在RNA-seq的技术路线中，首个环节是总RNA的提取，其质量决定着下一步mRNA的富集质量以及后续的建库等操作。如何选择和优化提取总RNA的方法，分离出获得高质量、高纯度和完整的总RNA，下文分享一则案例。
文章 | 基因慧编辑 | 罗湘 关键词 | NGS 质控
实例分析
样本类型：脐带血
实验方案：比较5种不同方法（试剂盒）提取同一分装样本总RNA的效果
质控仪器：Bioptic Qsep100
实验地点：某高校实验室
实验时间：2018年1月
图: 5种不同试剂盒提取脐带血总RNA
（来源/厚泽生物）
实验结果：如上图中所示，3号样本提取效果较差，得到的总RNA浓度低，提取过程中存在较多降解；1号、2号、4号和5号样本提取效果均比较好，得到的RNA质量较为完整（RQN＞7）。
本实验研究使用Qsep系列全自动核酸蛋白分析系统进行总RNA的提取质控。Qsep系列全自动核酸蛋白分析系统有不同型号，如下图。
图: Qsep系列全自动核酸蛋白分析系统
用户根据不同通量等进行选择。仪器操作简单，只需要将样本放入仪器选择相应的程序，即可对RNA样本进行自动上样分析，并且Qsep系列特有的分析软件Q-Analyzer能够自动抓取识别18S，28S两条带，并且自动得出28S和18S的比值以及得到RNA的质量指数（RNA quality number即RQN值）。
一般认为，在RQN值大于7时，即表明总RNA的质量不错。
Qsep系列全自动核酸蛋白分析系统除了可对总RNA进行质控分析，对cDNA、测序构建文库等也能进行质控，是NGS技术不可或缺的好帮手。
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