云计算助力精准医疗普惠大众,阿里云栖大会基因计算专场8位大咖干货分享

云计算助力精准医疗普惠大众,阿里云栖大会基因计算专场8位大咖干货分享

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关键字:云栖大会达摩院  基因计算专场
用时:约5分钟
编者:尘灰   |  校对:十一郎
昨日(2017年10月11日),阿里巴巴建立“达摩院”被刷屏——三年内投入1000亿元,为未来20的经济体打造。Slogan是”以科技创新世界”,与华大基因的“基因科技造福人类”异曲同工。同天下午,“基因计算”作为云栖大会专场之一,阿里云邀请了基因和计算行业8家单位负责人,分享了三代测序的计算校正、复杂基因组组装、肿瘤突变分析的敏感度、FPGA加速以及华大基因和阿里云合作的十万人基因组。基因慧作为受邀媒体,分享会议笔记如下。
 
云计算助力基因科技普惠化
马云老师的精彩讲话和观点一时之间刷爆网络,“达摩院”的宣布也引起网友们的热烈讨论:马云爸爸这是终于要造飞船返回母星了吗?
其实阿里巴巴正在做着很多与造火箭去太空同样伟大的事情,其中之一便是加快基因科技这一全球最前沿技术的普惠化,随着近年来基因测序技术的飞速发展,高通量测序成本的不断下降,基因大数据正以超乎想象的速度大量积累,为人群疾病防控,癌症药物筛查,甚至于人们的衣食住行等日常行为规律都提供了无限的可能。
 
随之而来的基因大数据的存储与计算却并未如基因数据的快速积累一样形成足够匹配,并造成了测序成本下降数据存储计算成本增加的问题。阿里云正是基于这一问题的出现,邀请了多位业内专家,在基因计算专场做了精彩的演讲报告及多个重磅宣布:
北京希望组CEO汪德鹏
北京百迈客技术总监王爱华
华大股份研发中心副总监金鑫
诺禾致源CTO田仕林
海普洛斯联合创始人兼CTO陈实富
Falcon Computing用户体验总监吴永俊
intel亚太区精准医疗业务负责人李健
阿里云基因计算产品负责人林河山
 
基因计算专场 | 演讲报告精华    
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基因计算专场 | 重磅发布    
1. 华大基因同阿里云达成合作,依靠华大基因自主研发的测序仪以及阿里云的计算分析能力,双方联手将在2018年分析交付10万个中国人的全基因组数据。
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2. 阿里云正式宣布同Aspera达成合作,为阿里云用户提供全球最领先的专线/高速通道。
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3. 阿里云正式宣布同Falcon COMPUTING达成合作,为阿里云用户提供FPGA加速。
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4. 阿里云正式发布Cromwell和GATK4.0的产品支持,并将同Intel和华大基因合作运营GATK中国社区,推动Cromwell这一标准工作流引擎在中国的落地。
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结语
基因科技和AI(人工智能)科技是时下突破性技术之一,在供给侧改革的经济大环境中,变革性应用型技术成为改善生产力结构、提高产业效率的重要因素。
基因大数据经过近七年的高通量测序技术产业化的积累,正在经历数据计算、传输和解读的瓶颈。而这依赖云计算等基础设施平台和协作,包括上文提到的三代测序的的计算校正、复杂基因组组装、肿瘤突变分析的敏感度、FPGA加速以及华大基因和阿里云合作的十万人基因组,都将成为日后基因行业数据标准化和规范化的资源池,也是智能计算的格式化数据入口。
目前基因大数据和智能计算这一交叉学科和产业仍在数据积累的初级阶段,预计5年左右的价值裂变,基因慧将关注这两大方向,和合伙伙伴一起为您提供专家专利、产业创业和资本并购的一手信息和解读。
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