基因慧CSCO报道 | 9月28日《分子标志物与个体化诊疗论坛2》专场

 

《CSCO 2017分子标志物与个体化诊疗论坛2》专场速记

关键词:乳腺癌、白血病、临床生物信息学、

肿瘤、ctDNA、CTC循环标志物

共3150字 建议用时5分钟

图:论坛现场拍摄,侵删。

 

一、乳腺癌临床标志物的应用及研究进展

廖宁 广东省人民医院肿瘤中华关心乳腺科行政主任

  1. 生物学性质并不只是由解剖结构决定的,特别是在关于治疗是否获益的预测中,还要考虑到基因的作用。
  2. 不同预测危险分层的基因假说也存在一定的不一致性
  3. 多种基因检测可预测早期乳腺癌患者预后:Oncotype DX、Mammaprint、Prosigna、Endopredict等方法。 Onotype DX也能够识别出能够从辅助化疗中获益的患者。
  4. 明确哪种检测方式准确性最高后,提供带来的帮助:提供预测的分子标记物、前瞻性数据(包括样本数、是否随机以及随访随访时间等)
  5. 根据淋巴瘤情况进行ROR评分预测复发风险;PAM50基因分析较RS分析判断中危风险淋巴结阴性患者更少
  6. 基因的检测应该成为ER阳性、HER2阴性,淋巴结阴性的早期乳腺癌患者临床治疗决策标准的一部分。

 

二、白血病精准诊疗中的生物标志物的分析与应用

邱林  哈尔滨血液病肿瘤研究所

  1. 生物标记物引领白血病精准医学的发展,从1674年的显微镜技术到1977年的一代测序、1983年的PCR到2000年的NGS,分子标记物的检测为推白血病的精准治疗提供强大技术支撑。
  2. AML的五年生存率37%,中位生存期6月(1989-1997,n=1044)
  3. 分析维度包括:表观遗传、黏连蛋白、剪切体、转录因子、TP53、信号通路等。
  4. 血液病的复杂性在于亚克隆,亚克隆的可能是一个或多个基因的突变。通过NGS定位,比较治疗前及复发后AML亚克隆改变,根据基因突变设计个体化免疫治疗。
  5. 马军所长将启动二代测序AML患者MRD多中心临床试验,58家医院参与,覆盖500例样本的96个突变基因、43种融合基因等。
  6. Ph-Like的ALL预后不好,目前已有相关筛查试剂。
  7. ALL复发常见基因突变谱,包括NT5C2、CNCNA1H、NR3C1、CREBBP、MLL2、KRAS等。
  8. 未来AML的精准医疗从患者的MICM NGS,到白血病的化疗、靶向治疗、免疫治疗、支持治疗和HSCT等,到巩固治疗。

 

三、临床生物信息学在精准医疗中的应用 

王向东 上海市临床生物信息学研究所研究所 所长

1、 临床生物信息概念

融合临床信息学、生物信息学、医学信息学、信息技术、数学、计算机科技、统计学、各种组学为一体的新兴科学。

提供分析临床多组学信息的理论和工具、推动临床医学信息化、标准化、系统化,创建病人信息智能档案系统、动态服务。

2、从十三五重大项目看临床生物信息学重要性

从大样本、大数据(队列研究、组学分析)到知识库(文本资源、生物信息)到精准医学目标和应用(科研上信息查找、分析和创造共享、临床精准诊疗和健康管理等)

3、临床生物信息学临床应用于研发

  • 从疾病患者及高危人群队列到临床信息样本库
  • 临床信息样本库,结合临床信息学、基因和蛋白谱来定位易感靶向分子
  • 通过靶向基因芯片、靶向蛋白芯片指导疾病特异性早期诊断盒研发、大样本大人群临床评估和验证等
  • 应用与早诊准确率、个体化治疗有效性及患者存活率。

4、路线:建立检测方法和理论、建立新兴技术大数据流程和策略、整合新兴技术大数据网络、应用疾病分型和诊断、形成个体化诊治的中山策略。

5、开发产品,比如肝癌小Panel,和华大基因及一个美国公司开发第二代单分子分选仪。

 

四、消化道(胃癌或CRC)肿瘤的标志物应用与进展

陈功  中山大学附属肿瘤医院结直肠科副主任医师

MMR/MSI

1、MMR功能缺陷(因)到MSI表型(果),80-85%结直肠发生与MMR相关

2 、MMR基因功能的检测包括3个途径:MMR基因胚系突变检测、IHC检测MMR蛋白、PCR检测MSI状态。

3、 MMR/MSI临床应用:

  • 胚系突变诊断Lynch综合征
  • 预后良好的指标(可能与淋巴细胞浸润有关)
  • 辅助化疗疗效预测指标:dMMR者FU辅助化疗不能获益
  • MMR与免疫治疗:MMR作为特征显示NIVO治疗 50-60%的response;MMR作为mCRC治疗指征,和PD-1表达水平不关联。

4、EGFR型号传导通路是肠癌中除了MMR最有价值的通路之一。

5、结直肠癌分子分型共识

  • CMS1(MSI/免疫型,14%,MSI/dMMR等分子特征)
  • CMS2(经典型,37%,高SCNA等)
  • CMS3(代谢型,13%,低SCNA、低CIMP等)
  • CMS4(间质型,23%,间质浸润)

6、ctDNA

预测预后价值:目前临床还不能成熟应用,但很有前景。

 

五、ctDNA在临床肿瘤学的应用与研究进展

朱冠山  厦门艾德生物医药科技股份有限公司

1、ctDNA应用价值

  • 作为肿瘤组织的替代和补充:组织样本有时并非合适或者足量;反复活检操作性不强;活检面临肿瘤异质性等
  • 靶向药疗效检测
  • EGFR-TKI治疗中EGFRm的动态监测(肿瘤异质性)
  • ctDNA检测可实现快速检测快速报告(活检到报告一般需要7天,ctDNA检测只需4小时)
  • ctDNA检测癌症:Panel可检测出肿瘤(NSCLC),ctDNA全基因组测序检测出孕妇癌症

2、ctDNA特点

  • 高度但有规律的片段化
  • 个体间差异显著且浓度低者众多

3、技术平台

  • ARMS技术(ADx, Qiagen, Roche),特异性接近100%,敏感度65%
  • 数字PCR 敏感度 80%
  •  NGS敏感度比ARMS稍高,更适宜检测ALK与ROS1的融合,特别是在超过10个基因的多基因检测。敏感度在于测序深度和更多技术投入
  • 开发了Super-ARMS,敏感度82%,特异性较高

 

六、基于CTC循环标志物的应用与研究进展

刘毅  军事医学科学院附属医院全军肿瘤中心肿瘤学研究室分子诊断项目负责人

1、应用最多的是CTC和ctDNA,外泌体正在积累更多的证据

2、ctDNA聚焦点突变,相对而言CTC是完整细胞形态(转录组、基因组、蛋白组以及细胞形态等)

3、CTC 90%以上来自上皮细胞,先富集,再计数、分析。

4、应用:

  • 早期筛查、辅助诊断及分析,现有证据上尚不充分
  • 术后复发风险监测(比如肝癌)
  • 预后判断(相对最成熟,比如乳腺癌、结直肠、非小细胞肺癌等),美国一项非小细胞肺癌的CTC研究 的cutoff是50,中国的一项非小细胞肺癌CTC cutoff是10
  • 晚期患者根据CTC变化更改治疗方案(CirCe 01研究)
  • 识肿瘤内在机制:比如转移机制
  • 实时分子分型指导治:比如,CTC HER2状态对乳腺癌靶向治疗有重要指示作用。

5、新一代的CTC检测技术

  • CTC-Chip(1ml血液里检测出达到几十到上百个CTC,两步双重富集)
  • CTC-iChip
  • 纳米粘扣芯片
  • 根据细胞大小富集,比如法国的ISET
  • 根据离心惯性富集(纳米中心)
  • 体内采集技术(CellCollection)

6、未来CTC如何更好满足临床治疗需求

  • 更高富集效率
  • 特异的验证策略
  • 准确性和重复性
  • 可操作性和推广性
  • 充分考虑异质性
  • 更多循证医学证据

CTC应用的癌种,包括乳癌(证据最充分)、结直肠癌、肺癌、前列腺癌等,CTC临床应用前景光明但路途遥远。

 

注:以上现场速记未经嘉宾确认,不代表任何公司的立场,仅供学术参考。原创内容、转载请注明出处。

 

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