基因周报 | 新冠如何入侵人体?西湖大学研究登上Science封面

【基因简报GeneMail】No.90期速览
  • 新冠病毒如何入侵人体?西湖大学研究结果登上Science封面
  • 一览全球新冠病毒检测机构最新动态:Broad、BGI、Proteona、54gene等
  • 我国将建设若干国家技术创新中心,为科技型中小企业提供创新服务
  • 近期融资:瀚辰光翼、光与生物、杰毅生物、达健生物。
  • 【辟谣】国外应用我国新冠检测试剂盒不准?没有明确使用范围和正确使用
  • 【新冠】截至3月29日24时,我国31个省(自治区、直辖市)和新疆生产建设兵团报告新增确诊病例31例,境外输入病例30例,本土病例1例(甘肃1例);累计确诊病例81470例,累计死亡病例3304例。累计收到港澳台地区通报确诊病例977例;截至3月30日7时45分,全球新冠肺炎确诊病例已经超过72万例,达720117例,死亡病例33925例(来源:国家卫健委及人民日报海外网)
* 往期简报重点分析已收录至《2020基因行业报告》,戳文末购买电子版。

首发/基因慧(公众号:GeneClub-1)

 编辑/Whiteney@基因慧

  封面图/摄图网


头条
1、Science | 新冠病毒如何入侵人体?西湖大学解析关键受体ACE2结构
新型冠状病毒(SARS-CoV-2)如何感染人体细胞?起连接作用的是新冠病毒受体ACE2(血管紧张素转化酶2)。关键在于新冠病毒的S蛋白与人体ACE2蛋白的结合。准确地说,是S蛋白“劫持”了原本是控制血压的ACE2,通过与它的结合入侵人体。

西湖大学特聘研究员陶亮比喻道:“如果把人体想象成一间房屋,把新冠病毒想象成强盗,那么ACE2就是这间房屋的‘门把手’;S蛋白抓住了它,病毒从而长驱直入闯进人体细胞。”对 S 蛋白和 ACE2 的研究,成为解读新冠病毒侵入细胞过程的关键,西湖大学周强团队正是揭示了新冠病毒S蛋白是如何劫持ACE2这个“门把手”。

当地时间3月27日,Science封面刊发西湖大学周强团队基于利用冷冻电镜技术,解析新冠病毒受体ACE2全长结构,这也是全球第一次成功解析ACE2的全长结构,对研究新冠病毒疫苗和治疗药物等提供了极其重要的线索。

ACE2很难在体外稳定获得,常常是与肠道内的一个氨基酸转运蛋白B0AT1打包一同出现。西湖大学团队也解析出ACE2全长蛋白与新冠病毒S蛋白受体结合结构域的复合物结构,整体分辨率2.9埃,其中S蛋白受体结合结构域部分的分辨率为3.5 埃。研究人员可以看到新冠病毒表面的S蛋白到底是由哪些氨基酸与ACE2相互作用。

△ 图:上图为近期Science封面;下图为ACE2-B0AT1复合物结构图概览(来源/Science

(本文参考自西湖大学官网https://www.westlake.edu.cn/info/1017/4362.htm)


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数据下载>>>

西湖大学周强团队的ACE2全长蛋白与新冠病毒S蛋白受体结合结构域的复合物原子坐标下载地址:https://www.jianguoyun.com/p/DVLSdMkQiJ2OCBjbwt8C

西湖大学周强团队的ACE2全长蛋白与氨基酸转运蛋白的原子坐标下载地址:(关闭状态)https://www.jianguoyun.com/p/DSJqlq4QiJ2OCBjCwt8C;(开放状态)https://www.jianguoyun.com/p/DWdO-qMQiJ2OCBjGwt8C


2、新冠检测 | 一览全球新冠病毒检测机构最新动态
△ 图来自FDA官网


中国,华大基因研发并捐赠或销售的试剂盒已送达全球11个国家。截止3月23日,武汉火眼实验室累计接收样本近23万例,全国各中心新冠病毒核酸检测每日通量达到6万人份。

美国,Broad Institute上周表示,其基因检测中心已被命名为马萨诸塞州立参考实验室,并已开始处理来自新英格兰地区患者的COVID-19测试样品。从收样到完成检测目前约需24小时,未来采用自动化措施后预计12小时。

新加坡,当地时间3月25日,Proteona宣布启动单细胞多组学联盟,该联盟将对从COVID-19中康复的患者的B细胞进行单细胞测序,以帮助研发治疗新冠的抗体。参与该联盟的机构包括10x基因组学、NovogeneAIT、海德堡大学医院、蒂宾根大学医院、德国癌症研究中心、蒂宾根大学NMI自然与医学科学研究所、新加坡国立大学等。

美国,Opko Health与Larkin社区医院等合作,为南佛罗里达,海厄利亚和好莱坞的Drive Through(不下车服务)提供检测。

日本,Enzo Biochem旗下的临床检测公司,通过其位于纽约州Farmingdale的实验室,扩大COVID-19的筛查服务。

美国,Sophia Genetics和Paragon Genomics合作推出用于COVID-19冠状病毒检测CleanCOx SARS-CoV-2 Panel。

非洲,基因组公司54gene筹措约50万美元的基金,来扩展日检测通量到5,000个,来应对尼日利亚COVID-19的挑战。


政策
3、科技部 | 建设国家技术创新中心,突破产业关键技术瓶颈
△ 图来源科技部官网

3月25日,科技部官网公布《关于推进国家技术创新中心建设的总体方案(暂行)》。《方案》指出,到2025年布局建设若干国家技术创新中心,突破制约我国产业安全的关键技术瓶颈,为科技型中小企业孵化、培育和发展提供创新服务,为支撑产业向中高端迈进、实现高质量发展发挥战略引领作用(科技部)。


4、FDA | 3月25日完善COVID-19检测诊断的指导政策
当地时间3月25日,FDA在周三举行了一次网络研讨会,以完善其不断更新的COVID-19检测诊断的指导政策,提供有关商业和国家实验室中分子和血清学诊断测试以及商业测试产品和设备的监管途径的关键见解。在FDA官网的FAQ网页中列明了四家新冠病毒检测研发机构:Becton Dickinson, Qiagen, BGI和Co-Diagnostics。其中BGI为中国企业华大基因。更多FDA对COVID-19相关指南信息>>>

https://www.fda.gov/emergency-preparedness-and-response/coronavirus-disease-2019-covid-19/covid-19-related-guidance-documents-industry-fda-staff-and-other-stakeholders


科 研
5、Cell  | 中科院从基因组学角度研究新冠病毒起源
近日,Cell在线文章发表了复旦大学和悉尼大学从基因组学角度探究新冠病毒起源的成果。文章结论部分表示,SARS-CoV-2成为人类中的第五种地方性冠状病毒(其他四种为HKU1,NL63,OC43和229E),目前正在完全易感人群中传播。冠状病毒具有跨越物种边界并适应新宿主的能力,可以越策未来还会出现更多种病毒。鉴于野生动植物中病毒的多样性以及它们的持续进化,对动物冠状病毒的监视应包括蝙蝠以外的动物,因为中间宿主的作用可能非常重要。降低未来爆发风险的最简单、最具具成本效益的方法是尽可能限制我们对动物病原体的接触。

文献PDF>>>

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6、Cell  | 复旦大学和悉尼大学从基因组学角度探究新冠病毒起源
近日,Cell在线文章发表了复旦大学和悉尼大学从基因组学角度探究新冠病毒起源的成果。文章结论部分表示,SARS-CoV-2成为人类中的第五种地方性冠状病毒(其他四种为HKU1,NL63,OC43和229E),目前正在完全易感人群中传播。冠状病毒具有跨越物种边界并适应新宿主的能力,可以越策未来还会出现更多种病毒。鉴于野生动植物中病毒的多样性以及它们的持续进化,对动物冠状病毒的监视应包括蝙蝠以外的动物,因为中间宿主的作用可能非常重要。降低未来爆发风险的最简单、最具具成本效益的方法是尽可能限制我们对动物病原体的接触。

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7、Nature | 浙大发表首个人类细胞图谱
△ 图:论文截图(来源/Nature 

3月25日,郭国骥团队与浙江大学附属医院张丹团队等合作在Nature上发表了题为“ Construction of a Human Cell Landscape at Single-cell Level ”的论文。通过对60种人体组织样品和7种细胞培养样品进行Microwell-seq高通量单细胞测序分析,系统地绘制了跨越胚胎和成年两个时期,涵盖八大系统的人类细胞图谱。

原文见>>>

https://www.nature.com/articles/s41586-020-2157-4


8、新冠疫苗 | 中国重组新冠疫苗获批启动临床试验
3月16日,军事科学院军事医学研究院陈薇院士领衔的科研团队研制的重组新冠疫苗,通过临床研究注册审评。当日20时18分,获批正式进入临床试验。(中国军网)原文见>>>

http://www.81.cn/syjdt/2020-03/17/content_9771126.htm


9、新冠疫苗 | 美国完成新冠疫苗人体测试第一针
△ 图来源NIH

美国时间3月16日,由美国国立卫生研究院(NIH)和Moderna合作开发的新冠疫苗mRNA-1273,进行了新冠病毒疫苗人体测试第一针。(NIH)

原文见>>>

https://www.niaid.nih.gov/news-events/nih-clinical-trial-investigational-vaccine-covid-19-begins


10、The Lancet | 基因检测帮助晚期胰腺癌患者延长生存期超一年
3月2日,由全球顶级癌症机构安德森癌症中心领导的真实世界研究,发表在The Lancet Oncology上。回顾性分析了2014年-2019年间接受KYT计划的1856例胰腺癌患者。结果显示接受匹配疗法的患者自诊断为晚期后的中位总生存期延长了近一年(2.58年 vs 1.51年),死亡风险降低58%!原文见>>>

https://www.thelancet.com/journals/lanonc/article/PIIS1470-2045(20)30074-7/fulltext


应 用
11、梅里埃 | COVID-19检测试剂盒获FDA紧急使用授权
北京时间3月24日,梅里埃研发生产的BIOFIRE® COVID-19检测试剂盒获FDA紧急使用授权(EUA, Emergency Use Authorization),可在现有的FILMARRAY®2.0以及FILMARRAY®TORCH平台上运行。此前,其SARS-COV-2 R-GENE®已完成产品研发及上市。(梅里埃诊断)


12、华大基因 | 新冠病毒核酸检测产品获FDA紧使用授权
△ 图:上下滑动浏览FDA签发文件(来源/华大基因)


美国时间3月26日,华大基因(BGI Genomics)研发生产的新型冠状病毒核酸检测试剂盒(Real-Time Fluorescent RT-PCR Kit for Detecting SARS-2019-nCoV),获美国FDA紧急使用授权。3月18日,该检测产品根据美国《新型冠状病毒肺炎在公共危机下的诊断检测政策指南》规定在美国上市。(FDA)

原文见>>>

https://www.fda.gov/media/136472/download


13、新冠治疗 | 瑞德西韦获FDA孤儿药资格,吉利德申请放弃资格
△ 图:(来源/FDA)

美国时间3月23日,吉利德(Gilead Sciences)公司开发的在研抗病毒疗法瑞德西韦(remdesivir)获FDA授予孤儿药资格,其适应症为冠状病毒疾病2019(COVID-19);3月26日,吉利德发布声明,宣布已经向美国FDA提出申请,要求FDA收回授予瑞德西韦的孤儿药资格,并且放弃与孤儿药资格相关的所有优惠权益(例如七年市场独占期)。

原文见>>>

https://academic.oup.com/nsr/advance-article/doi/10.1093/nsr/nwaa036/5775463


产 业
14、近期融资事件:达健生物、瀚辰光翼、光与生物、杰毅生物
3月27日,专注于肿瘤早期诊断的广州达健生物科技有限公司,宣布完成1亿元A轮融资。本轮融资由华大共赢领投,海南一投、鲁信创投、趣道资产等跟投。3月24日,自动化分子检测设备公司成都瀚辰光翼科技有限责任公司,宣布已于今年年初完成数千万元A+轮融资。投资方为北极光创投、博远资本、复星集团星未来资本、允治资本。

3月21日,致力于单分子检测技术研发的深圳市光与生物科技有限公司,宣布完成2000万元天使轮融资。

3月17日,致力于革新感染性疾病检验未来的杭州杰毅生物技术有限公司,宣布完成近亿元Pre-A轮融资。本轮融资由比邻星创投、普华资本和体外诊断资深产业人士等联合投资。


15、艾德生物&强生 | 伴随诊断战略合作
3月24日,艾德生物(SZSE:300685)宣布与跨国药企强生(Johnson & Johnson)达成伴随诊断战略合作。艾德生物将依凭自主知识产权的NGS技术平台,推进维惠健®(2018年11月20日获NMPA批准上市)的变更注册,扩大伴随诊断范围,支持强生肿瘤产品线。(艾德生物)


16、新冠治疗 | Twist提供抗体和合成DNA支持新冠治疗研究
当地时间3月26日,Twist Bioscience周四宣布,已和范德比尔特大学医学中心(VUMC)签署协议,向VUMC提供抗体、合成DNA和抗体药物发现库,以支持COVID-19潜在疗法的开发。

17、德勤报告 | 生命科学兼并收购热潮中中国仅次于美国
近日,德勤(Deloitte)发布《2020年全球生命科学展望》。报告指出以面向患者的创新价值为中心,结合数字化技术商业化发展。基因和细胞疗法加速市场化,尤其是罕见病药物。生命科学兼并收购热潮中中国仅次于美国,体外诊断在全球医疗技术市场中仍处于老大。(基因慧)

如您已注册YourMap,可直接下载《2020年全球生命科学展望》PDF>>>

http://www.yourmap.net.cn/Public/knowledges/1584955340.pdf(粘贴网址到浏览器)


战 疫
18、疫情播报 | 全国境外输入递增,全球确诊人数超51万
我国新增确诊病例31例,境外输入30例

截至北京时间3月29日24时,31个省(自治区、直辖市)和新疆生产建设兵团报告新增确诊病例31例,其中境外输入病例30例,本土病例1例(甘肃1例);新增死亡病例4例(湖北4例);新增疑似病例17例,均为境外输入病例。当日新增治愈出院病例322例,解除医学观察的密切接触者1575人,重症病例减少109例。

现有确诊病例2396例(含重症病例633例),现有疑似病例168例。累计确诊病例81470例,累计治愈出院病例75770例,累计死亡病例3304例,累计追踪到密切接触者704190人,尚在医学观察的密切接触者19235人。

累计收到港澳台地区通报确诊病例977例:香港特别行政区641例(出院118例,死亡4例),澳门特别行政区38例(出院10例),台湾地区298例(出院39例,死亡3例)(国家卫健委)。

全球新冠确诊病例超过72万例,死亡超3.3万例

据美国约翰斯·霍普金斯大学实时统计数据显示,截至北京时间3月30日7时45分,全全球已有200多个国家和地区出现新冠肺炎病例,确诊病例已经超过72万例,达720117例,死亡病例33925例。

美国是确诊病例数最多的国家,累计达140886例,超过14万,死亡病例2467例。有11个国家确诊病例数过万。除了美国外,累计确诊病例数目较多的国家包括意大利、西班牙、德国、法国、伊朗、英国19780例、瑞士、荷兰、比利时等(人民日报海外版)。


辟谣
19、国外应用我国新冠检测试剂盒不准?| 没有明确使用范围和正确使用
之前,有媒体报道国外应用我国新冠病毒检测试剂盒不准。这里提供几点点参考信息。1)RT-PCR、基因测序及抗体检测三种方法纳入我国新冠肺炎诊疗方案

2)新冠肺炎不同阶段不同场景下需采用不同方法

无论是美国FDA、世界卫生组织还是国家药监局表示,抗体检测作为核酸检测的重要补充。特别地,国家药监局表示,鉴于抗体检测试剂方法学特点,该产品仅用作对新型冠状病毒核酸检测阴性疑似病例的补充检测指标或疑似病例诊断中与核酸检测协同使用,不作为新型冠状病毒感染的肺炎确诊和排除的依据,不适用于一般人群的筛查。仅限医疗机构使用(点击详情

而仅基于测序,不同方法的应用场景也不同,根据华大集团最新相关方法学研究预印文章介绍(点击链接),对超高深度宏基因组测序、多重PCR扩增子测序以及探针捕获测序三种方法进行了对比。(声明:以上引用,不存在利益冲突)

3)涉及事件的企业和国家已作出声明。个别企业的独立批次事件,不能误认为或传播为中国所有新冠检测试剂盒的问题。


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 拓展阅读 
▲ 为什么说基因产业是万亿级市场?
▲ 《2020基因行业报告》增订电子版发布 
▲ 基因慧参与国发改最新《战略性新兴产业发展展望》编写

2020基因行业报告 

一览基因产业图谱及发展趋势

《2020基因行业报告》增订版发布(提纲)



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☆ 国家发改委《战略性新兴产业发展展望》编委

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☆ 主办数字健康私董会粤港澳大湾区生命健康创新论坛

☆ 受邀为华西医院Illumina华大上海交大等大会作报告

☆ 广东省精准医疗应用学会政策研究应用分会、遗传病分会常委

☆ 第九届中国深圳创新创业大赛盐田区决赛评委

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