NGS数据分析提速超百倍,赛乐基因亮相2019年CSCO | CSCO瞭望

第22届全国肿瘤学大会暨2019 CSCO学术年会刚刚落下帷幕。作为国内最盛大的肿瘤学学术会议,CSCO吸引了全球约3万名业内观众、600余位专业讲者及优秀精准医疗企业参展。赛乐基因作为参展企业之一,在CSCO上隆重推出最新自主研发的BaseNumber超高速生物信息分析平台。

赛乐基因作为CSCO 2019的参展商,在本次大会上隆重推出了其最新自主研发的BaseNumber生物信息分析平台及BaseNumber Germline胚系变异检测流程。该流程目前可处理WGS、WES及Target Panel数据。凭借其极致的运算速度、精准的变异识别,BaseNumber吸引了大量与会者的目光。
图:赛乐基因参展CSCO 2019(来源/赛乐基因)
 
赛乐基因向参观者现场演示了BaseNumber Germline在16分钟内完成一个“37X”人类WGS数据二级分析的全过程(从FASTQ.GZ文件到VCF文件);与传统的“CPU服务器+开源软件”方案比较,提高速度达140倍,且检测结果与业界使用最广泛的GATK Best Practice高度一致。许多来自临床检测公司、科研单位、药企、医疗机构的专家在参观完产品演示后纷纷表示BaseNumber Germline在高准确性的基础上分析速度如此之快超出了他们的想象。

图:与会者参观赛乐基因展台(来源/赛乐基因)

 
BaseNumber分析平台由赛乐基因基于CUDA架构研发,通过设计超高并行度的分析算法及高吞吐的内存管理模块,充分利用了GPU SIMT计算模型的优势。相比于传统的服务器集群解决方案,BaseNumber平台一个计算节点可以取代数十台CPU服务器节点,能极大节省用户消耗在IT系统建设和维护上的成本。

 

图:BaseNumber一体机及Germline胚系变异检测流程(来源/赛乐基因)
 
随着新一代测序技术的不断发展,测序速度大幅提升、成本急剧下降,NGS数据生物信息分析在计算效率与成本控制等方面正面临愈来愈多的挑战。赛乐基因的技术与产品为解决目前NGS生物信息分析 “慢”且“贵”的问题提供了一套创新、有效的解决方案,助力NGS在肿瘤学研究和临床实践中的广泛应用。
 
关于赛乐基因
赛乐基因科技(北京)有限公司是一家面向全球医疗、基因测序及科研机构提供NGS生物信息分析解决方案的Bio-IT公司。公司致力于融合最前沿的生物信息技术和IT技术,革命性提升NGS生物信息分析的效率和准确性,同时大幅降低分析成本,从而推动精准医疗和基因科技产业的发展。
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来源:赛乐基因

编辑:Nicole

 

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