【大咖论健】总第02期:药明康德集团企业明码生物科技CTO孙洪业

1:06  明码生物科技CTO孙洪业寄语来自基因慧PPT

明码生物CTO 孙洪业

导读
精准医学纳入“十三五”;在临床应用上,基因诊断扩大适用范围,二代测序诊断试剂盒和肿瘤免疫治疗单抗获FDA批准;国产测序仪量产,实现个人基因组进入百美元时代;基因与健康管理、保险、司法鉴定等跨界融合;第582次香山会议商讨“中国微生物组计划(CMI)”;Google,IBM,BAT,华为等IT巨头逐鹿基因大数据云平台;同时,科普依然短缺,应用未形成闭环,标准规范尚未成熟;产业概念期已过;2017年可以预见并购重组,进入又一轮高潮。基于此,作为行业的互联网连接器,基因慧独立策划和主办《精准医疗大咖论道》,探索科研、临床、产业、资本之间的了解、连接和资源共享。系列一邀请十余位产业大咖联袂撰文,梳理和展望科技创新、应用转化、产业发展到行业走向。第二期邀请明码生物科技CTO孙洪业。感谢贝壳社的媒体支持。

往期嘉宾:

华大股份CEO尹烨(点击链接可见详情

本期嘉宾

本期嘉宾,基因慧邀请了药明康德集团企业明码生物科技CTO和中国区负责人孙洪业博士。药明康德从2015年8月初次宣布私有化到完成,仅用了4个月;从医药CRO、CMO、细胞治疗(2016年和Juno Therapeutics合作建立中国合资公司)、投资(2011年起)到基因科学、健康管理,布局深远。作为其中核心之一的基因板块的明码生物科技(WuXi NextCODE)始于2011年的基因组中心,并在2015年以6500万美金收购从deCODE分离的NextCODE Health公司,是第一批购进HiSeq X Ten的企业之一,并和Foundation Medicine、复旦大学附属儿科医院,DNAnexus、华为、软件等展开了深入合作,在临床、健康管理和生殖健康等领域赋能基因技术。孙洪业作为明码生科科技的CTO和中国区负责人,以DNA测序研发的科学家出身,严谨、精力充沛,是一名充满激情的创业者,带领明码生物科技在基因行业发展迅猛,成为有影响力的品牌之一。

孙洪业(药明康德集团企业明码生物科技CTO和中国区负责人孙洪业博士)
孙洪业,博士,于北京大学获得博士学位,并在哈佛大学及堪萨斯大学分别从事博士后研究工作。2011年加入药明康德并创建基因组学中心,致力于应用基因组学方法解决药物发现、临床开发和个性化医疗的问题。曾供职于Applied Biosystems(现在Thermo Fisher公司),拥有超过10年的DNA测序技术研究与开发经验,作为一个领导者为应用生物系统公司撰写第一到第四代DNA测序技术研发的白皮书。
 

路漫漫其修远兮,吾将上下而求索

——药明康德集团企业明码生物科技CTO和中国区负责人孙洪业博士之大咖论道

有幸受到基因慧的邀请,来参加第二期的《精准医疗大咖论道》活动,我谨代表药明康德集团企业明码生物科技在此表示衷心感谢。正值岁末,附诗一首以回顾和总结明码生物科技的成长和收货。

医学云端搭平台,福码备孕显关爱。

标准规范铭于心,国际舞台展风采。

 

——长风破浪会有时,直挂“云”帆济沧海——

随着互联网的普及和大数据技术的发展,”云“已经被特指为通过互联网资源共享的一种术语。大数据和云计算已经渗透到人们生活的方方面面。Google、亚马逊、微软、苹果等互联网巨头竞相积极布局精准医疗健康行业,在云端建立了运算、存储、数据挖掘以及共享机制,全球基因组云存储市场规模增长潜力巨大。

正是看到了这样的机遇,明码生物科技已经分别与DNAnexus、微软等达成了战略合作。在此基础上,明码生物科技于2016年5月联合华为企业云发布了中国首个精准医学大数据云平台——明码云:提供一站式易学好用的基因分析平台。明码生物科技携手华为的目标就是实现互惠互利,携手共赢。明码生物科技与华为的理念一致,不经营客户的数据,永远不从客户的数据上获取价值,而是与合作伙伴一起保护客户数据。

明码云的核心是NextCODE软件系统,这套系统已处理超过35万人的全基因组数据,能随时随地分析基因序列数据,其卓越能力得到广泛认可。目前,NextCODE软件系统已在明码云全面上线,可为临床医生及科研工作者提供从基因组二级分析、三级分析到临床科学数据解读的全面服务。明码云服务资源可随时使用,通过网站上的简单操作即可快速获取所需的专业资源,可按需配置、计量收费、用完释放。海量的资源池可定制化、操作简单、弹性可扩展而且管理界面友好。明码云实现资源最大程度的共享,同时有利于数据集中进行大数据分析共享。

明码云正全力以赴打造一个覆盖全国、标准统一、安全可靠的精准医学大数据云平台,共同推动国内基因组信息及精准医学大数据的集中和应用。然而,当初在筹划云平台的过程中,要从无到有,在国内搭建一个全新的交叉学科精准医学云平台,还是存在许多困难和挑战。感谢我们的团队和业务伙伴在最短的时间内顺利完成明码云的公开上线,又一次实现了“中国第一”。在平台上线后的实际运行中,明码云也暴露出一些问题,明码生物科技努力迎接挑战,不断优化完善明码云,使得平台更加稳定,功能更加强大,为中国的精准医学服务!

                           
图1 明码生物科技打造国内第一个精准医学云平台——明码云

 

 

——不积跬步,无以至千里——

明码生物科技的主营业务包括科研服务,涉及全基因组、全外显子组、转录组、表观遗传学等研究。随着高通量基因测序技术的成熟以及应用的扩大,明码生物科技一直在思考如何能利用多年积累的科研服务优势,为更多健康人群、临床病患提供更多高品质的服务。

就在刚刚过去的12月3日,明码生物科技举行了针对育龄人群的无创孕前基因筛查产品——“福码”(FamilyCODE)的发布会。“福码”可一次性筛查135种亚洲人群高发、早发、严重的隐性遗传病,涉及代谢、神经、肌肉、血液、内分泌、泌尿等多个人体系统。疾病列表由医学遗传学家团队经过大量的文献审核和数据分析总结得出。“福码”采用美国FDA认证的唾液采集器,便于使用者在家中无创、快速收集样本,只需0.75 mL唾液即可用于后续检测。实验在中国唯一一家通过美国临床实验室改进修正方案(CLIA)和美国病理学家学会(CAP)双重认证的明码生物科技实验室完成,质量领先符合国际标准。利用国际领先的临床序列数据分析系统CSA,准确计算和分析基因组大数据。通过微信公众号“福码服务”,客户可以方便地订购产品、跟踪流程、阅读报告以及预约遗传咨询。对于高风险人群,明码生物科技的遗传咨询团队可为客户提供专业的遗传咨询服务,帮助进行科学备孕。值得一提的是,“福码”从构思到研发落地,历时不到半年时间,我为明码生物科技高效的研发效率和团结协作精神点赞。

除了今年倾力推出的“福码”产品,明码生物科技去年还打造了“瑞码”(RareCODE)和“安码”(HealthCODE)。“瑞码”是一款遗传病临床辅助诊断产品,针对临床上难以确诊的罕见遗传病患者,提供端对端解决方案。使用高通量二代测序(NGS)技术对全外显子组进行测序,并使用NextCODE CSA分析平台,由临床遗传学家鉴别与患者的临床指征相关的基因变异,提供全面、快速的基因检测分析,帮助病患家庭重新找到希望。“安码”是一项基于全基因组测序的健康管理服务,仅需2 mL唾液或血液就可检测涵盖癌症、心脑血管病等重大复杂性疾病的近500种疾病风险,涉及24种高风险遗传综合征、30种常见疾病遗传风险、402种携带者状态,为客户提供全面而周到的高端健康咨询及管理服务。

《荀子•劝学篇》曰:“不积跬步,无以至千里;不积小流,无以成江海”。明码生物科技将始终凭借国际标准的质量体系和先进的技术平台,以福瑞安系列产品为契机,推出更多更加深入聚焦健康领域的产品,惠及人民大众。

图2 明码生物科技发布福码产品

 

 

——没有规矩,不成方圆——

明码生物科技秉承药明康德集团的高标准、规范化的理念,自成立伊始就不断坚持贯彻“合规”(Compliance)的概念。明码生物科技在内部制定了200余条管理规定和SOP(标准操作流程),正是这种高度的组织性、纪律性和规范性才让明码生物科技的服务能力赢得了广泛的认可。2016年2月,明码生物科技的测序中心实验室获得了美国病理学家协会(CAP)认证。这是继2013年明码生物科技的前身——药明康德基因组学中心获得美国临床检测实验室认证(CLIA)之后的又一次获得国际权威认定。明码生物科技已成为目前中国唯一一家同时获得美国CLIA认证和CAP认证的二代测序中心。2016年3月,明码生物科技通过了国家《企业知识产权管理规范》(GB/T29490-2013)标准审核,获得了由国家独立的第三方认证机构中知(北京)认证有限公司颁发的知识产权管理体系认证证书。这是对明码生物科技严谨规范的知识产权保护体系进一步认可,同时对公司未来知识产权保护和管理,激励科技创新,促进产业合作发展,为全球客户提供更高质量的服务具有重要意义。

在此,明码生物科技要感谢来自国际药厂和第三方派来的实验室质量检查的核查员。正是他们提出的的宝贵意见和建议锻造明码生物科技不断提升服务品质和业务规范的基石。同时,我一直给员工强调,每一个样品、每一个编码都是一个生命,必须要尊重样品、尊重生命,必须要严格按照SOP进行实验操作,必须严格符合合规以及知识产权保护条例。只有这样,才能勾勒出行业标准的天圆地方,才能让客户安心,进而使公司实现长期的社会价值。

 

——西行漫记,闪耀国际舞台——

明码生物科技一直致力于打造全球领先的精准医学领导者。既然是全球的领导者,就必须与国际质量标准接轨。明码生物科技建章立制的文档几乎都是英文,实验室的每一位技术员都能按照英文的SOP进行熟练试验操作。明码生物科技立足的不仅仅是服务中国本土的企业和用户,更是将眼光放眼全球,力争服务国际知名的大型制药企业甚至是国家级的精准医学基因组学计划。

2016年3月,明码生物科技与美国Simons Simplex Collection (SSC)基金会合作,实现了自闭症患儿家庭的10,000个外显子数据的云端实时查询。无需移动或下载数据就可以挖掘所有样本的突变信息。2016年11月,明码生物科技与总部位于都柏林的Genomics Medicine Ireland(GMI)达成战略合作关系,为GMI提供世界领先的基因组学能力平台,助力推进爱尔兰精准医疗计划。值得一提的是,这已经是明码生物科技第四个国家级的基因组学研究项目,以前的项目包括:与美国波士顿儿童医院合作研究儿童罕见病以及推进圣安东尼奥千人癌症全基因组计划;参与英国10万人国家基因组计划,提供罕见病及癌症临床数据解析服务;与卡塔尔锡德拉医学研究中心合作推动卡塔尔30万人国家精准医学计划等。

明码生物科技定位为国际化,那也就会面临更多的国际机遇和更强的竞争挑战。明码生物科技始终朝着精准医学全球领导者的目标奋勇前进,相信我们一定会在国际舞台上展现出更多风采。

 

——结语——

“凡事预则立,不预则废”,请各位一同期待明码生物科技在新的一年中的实际行动,努力真正成为精准医学领域的全球领导者,打造一个开放的平台式的生态系统,助力精准医学提高人类的健康水平,明码生物科技任重而道远。

【后记】感谢明码生物科技孙洪业博士的参与、支持和热情分享。以技术驱动的精准医疗产业,着力技术转化为应用。作为DNA测序技术研发出身的孙洪业博士经常称“我是一名科学家”,行如风,声如钟,是一位充满激的创业者,以科学家的严谨、创业者的热情带领明码生物科技短短五年从一个基因组中心发展成为行业领先的企业之一,在药明康德整体医药和健康布局战略下,开发出临床、健康、生殖健康等拳头产品,建立国内外有影响力之一的品牌。

这里,我也非常感激明码生物科技和孙洪业博士曾经的栽培。祝福!(基因慧 汪亮)。

敬请期待下一期大咖:思路迪创始人熊磊

附赠(每位嘉宾所在企业大事记)

明码生物科技大事记
2011
药明康德基因组中心成立

2011年7月,明码生物科技前身药明康德基因组学中心正式成立。
2013
获美国临床检测实验室认证

2013年10月,药明康德基因组学中心获得美国临床检测实验室认证(CLIA),成为亚洲首家CLIA认证实验室。NextCODE Health公司成立2013年,deCODE公司剥离大数据分析核心平台及团队,成立NextCODE Health公司。NextCODE Health是一家从deCODE 公司分离出来用独一无二的基因数据库(GOR) 和交互式生物信息分析统计工具对临床表型和基因型进行全面分析的领导者。

2014
第一批购进Hiseq X ten的公司之一

2014年6月,药明康德基因组学中心成为第一批拥有全球最先进的全基因组测序仪Illumina HiSeq X10的公司之一。
与Foundation Medicine战略合作

2014年10月,药明康德基因组学中心与美国Foundation Medicine Inc.公司宣布开展战略合作为在华临床试验提供领先综合基因组分析服务。
2015
明码生物科技成立,收购NextCODE Health

2015年1月,药明康德收购NextCODE Health公司,成立明码生物科技。
明码生物科技与美国波士顿儿童医院合作

2015年2月,明码生物科技与美国波士顿儿童医院合作。
明码生物科技与DNAnexu战略合作

2015年4月,明码生物科技与美国FDA认证的精准医学大数据处理平台DNAnexus建立战略合作伙伴关系。
明码生物科技参与10万人国家基因组计划

2015年6月,明码生物科技参与英国10万人国家基因组计划,提供罕见病及癌症临床数据解析服务。
明码生物科技与复旦大学附属儿科医院合作

2015年9月,明码生物科技与复旦大学附属儿科医院合作建立儿科遗传病联合实验室。
明码生物科技与Sidra医学研究中心合作

2015年10月,明码生物科技与锡德拉(Sidra)医学研究中心合作推动卡塔尔30万人国家精准医学计划。
2016
明码生物科技获得CAP认证

2016年2月, 明码生物科技获得美国病理学家协会实验室认证(CAP),成为中国唯一获得CLIA和CAP双重认证的实验室。
明码生物科技与Simons基金会合作

2016年3月,明码生物科技与Simons基金会就世界最大自闭症数据库展开合作。
“明码云”发布,与华为、微软合作

2016年5月,明码生物科技与华为合作推出精准医学大数据平台——明码云。2016年6月,明码云与微软Azure合作部署明码的基因综合分析系统。
“福码”发布

2016年12月,明码生物科技推出无创孕前基因筛查产品——福码(FamilyCODE)。
声明
1. 以上内容是基因慧策划、邀请行业大咖撰文,编辑成文。版权属于基因慧(北京基因界科技信息咨询有限公司)。在尊重版权情况下,欢迎传播。2. 我们秉持客观、严谨、中立的态度,从多方渠道收集并发布信息,供行业参考。但受收集当时信息公开的时效性,不同渠道存在不同见解,不能完全保证信息的完整性和准确性,如有错漏之处,欢迎指正。3. 以上观点仅代表作者本人,旨在基因慧第三方平台上传播、连接、探索。

 

精彩预告
1. 基因慧独家策划的《基因三人行》之《温故2016》活动,已邀请行业细分领域代表性企业和专家参与,第一期临床基因检测播出反响热烈(点击链接),近期将推出肿瘤基因检测、微生物组、个人基因组、生物云平台等专题。2. 《精准医疗大咖论道》第一系列邀请了十位CEO和企业高管,第二系列诚意邀请临床遗传或临床基因检测相关的临床大咖参与。(以上活动节目均诚邀冠名商务合作)

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