基因慧 2018年3月05日12:34
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茅矛 SeekIn(思勤)CEO
前药明康德公司转化科学和诊断部高级副总裁,前任华大基因股份有限公司首席科学官;韩国延世大学、广州中医药大学兼职教授,曾获教育部杰出青年教师奖;曾在默沙东、辉瑞工作15年,FDA批准的乳腺癌预后判断试剂盒MammaPrint发明人之一。
关键词:第11界基因组医学未来大会
Patient Story 古人类DNA ctRNA
思勤招聘
阅读用时:约7分钟
1、第11届基因组医学未来会议
全称:基因组医学未来会议(Future of Genomic Medicine 2018, FOGM18)
主办时间:2018年3月1日-2日
主办地址:美国加州,圣地亚哥,拉荷亚 (La Jolla)
主办方:Scripps Health
会议内容:围绕利用基因组学,实现个性化医学预防和治的目标,重点关注基因组编辑、肿瘤基因组、遗传学和预防医学,cfDNA、表观遗传学等基因组分析的热点。
图1, Future of Genomic Medicine 2018会议现场,茅矛拍摄
2、茅矛博士的会议笔记
A. 关键词:会议发起人Eric Topol
Future of Genomic Medicine是一年一度的大会。发起人是一个很有名的心脏学专家Eric Topol,他也是组学和数字医学的领袖人物,写过一本书《The Creative Destruction of Medicine》,这本书提出了数字医疗健康的概念。
图2, 书籍《The Creative Destruction of Medicine》,茅矛拍摄
B. 关键词:会议亮点:患者故事(Patient Story)
今年是我第8次参加这个会议,这个会议是我参加所有会议(不限于基因组学会议)中最喜欢的会议,每一个talk (报告)20分钟。主要以学术界和工业界代表为主,偶尔也请政府官员嘉宾。两天会议中,每一天会穿插一个“Patient Story”部分,由两个病人讲故事,讲他们疾病多么复杂,又如何被基因组学等技术所诊断以及找到治疗方法,从病人的故事和生动例子可以看到这个领域科技的进步,以及解决问题的应用,这也是这个会议的创新。
今年会议第二天的“Patient Story”环节中,一个荷兰籍患有脑部肿瘤的患者,结果诊断有NF2突变。因为他本身是IT领域的企业家,所以他用“Cloud Sourcing”的方法,把相同病人和这个领域的研究者聚集成社群,通过Hack(黑客)的方法寻找新的药物治疗疾病,给大家留下深刻的印象。
C. 关键词:基因学技术的学术前沿
会议开场,往往由Eric Topol讲30分钟的开场,关于这个行业的overview (纵览),今年这个会议也谈到热点话题,包括基因组编辑、肿瘤免疫治疗、大数据、古人类基因组等。
今年有一个很fun(有趣)的话题,来自Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology的Viviane Slon分析洞穴的土壤中的古人类DNA,来研究人类的进化。
这次来自学术界的几位大牛,包括:
1)Broad的Todd Golub主要讲通过前沿技术,包括测序技术,基因编辑技术等发现新的药物靶点;
2)斯坦福的Ash Alizadeh分享他研究的很有名的ctDNA CAPP-Seq的方法和应用;
3)斯坦福的Stephen Quake基于血液循环DNA,洋洋洒洒地从NIPT开始(母亲血液中游离的胎儿的DNA)、肿瘤病人的游离肿瘤DNA谈到血液中游离的微生物细菌病毒DNA,这里不仅提到ctDNA,还包括ctRNA等。
D. 关键词:基因组技术的工业应用
来自工业界的talk,使我们感到临床基因测序,发展地更加多样性:
1)Natera根据肿瘤病人组织测序的结果,定制和病人直接相关的突变Panel (大约20个基因),然后根据这个20个基因跟踪肿瘤病人的生存状况,非常个性化,类似于我们的个性化诊断一样。(编者注:Natera专注于生育健康和NIPT等基因组学技术)
2)Karius的CEO讲到NGS在感染性疾病的应用。相对于遗传病,虽然感染性疾病的应用比较小众,但是可以看出NGS技术的进步,成为诊断未知病原感染的一种行之有效的方法。(编者注:Karius致力于应用基因组学来分析微生物循环DNA来诊断传染病。)
3)Color Genomics在大规模的人群基因组测序方面比较专业。这里谈到重要的一点是,他的定价相对于其他厂商低很多,比如说遗传性肿瘤的Panel(20个基因左右)在美国定价为249美元。BRCA1/2检测只有99美元,比其他厂商上千元的价格低得多。整个公司的科研和市场营销都非常扎实(solid),值得学习。(编者注:Color Genomics以低成本提供高质量的基因检测,面向消费者提供遗传性疾病的风险评估服务)
广告:茅矛创建的SeekIn招贤纳士
东家介绍:SeekIn(思勤)是一家专注于肿瘤早筛的高科技公司,拥有多年在国际和国内的遗传学,基因组学,肿瘤学和分子诊断学领域的科研和成果转化的声誉。Slogan为“坚持真理、坚持人性”。创始团队为华大基因和药明康德前高管。
等你来:生物信息总监、实验室主管、人事行政总监和行政助理各一名;生物信息科学家和实验室研发技术人员各4-6人。
E. 关键词:宇航员、太空中的DNA测序
会议以Kathleen Rubins的演讲结束,Kathleen Rubins是一个宇航员,MIT的Whitehead Institute研究员,后来加入NASA成为宇航员。她在我们这个领域做的最重要的事情,是在国际空间站用Nanopore的MinIon做DNA测序[1]。
可以看出DNA测序发展很快,已经到达宇宙空间。这个实验并不是为了好玩,主要论证在宇宙空间是否可以做测序,以及探索未来的应用,比如空间站的未知病原感染检测等等。因为她的独特经历分享,听众对此反应非常热烈。
图3,宇航员Kathleen Rubins在国际空间站做DNA测序,来自Nanopore官网
F. 关键词:作家、记者、《The Gene Machine》
这个会曾请到了很多牛人, 比如NIH的Francis Collins等,工业界的Grail、Guardant Health、23andme等公司CEO等,学术界的几乎每一个名人都有参与。大会还会邀请著名的记者、作家,进行免费赠书和签名活动等。今年的这位作家为Bonnie Rochman ,她带来的书为《The Gene Machine》,据说这本书也被翻译成中文。主要内容是利用遗传学和基因检测方法,如何使得每个家庭拥有一个更健康的宝宝。(编者注:Guardant Health 专注于肿瘤健康领域)
图4, 书籍《The Gene Machine》,茅矛拍摄
【参考资料】
1.https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2016/09/27/077651.full.pdf
2.https://www.stsiweb.org/event/fogm18/
3.http://yourmap.net.cn/
编辑:Cindy
校对:Candice
审核:布三少

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